Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccl12Q62401 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccl12Q62401 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccl12Q62401 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccl12Q62401 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccl12Q62401 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccl12Q62401 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccl12Q62401 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccl12Q62401 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccl12Q62401 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl12Q62401 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl12Q62401 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl12Q62401 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl12Q62401 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl12Q62401 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl12Q62401 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl12Q62401 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl12Q62401 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl12Q62401 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl12Q62401 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl12Q62401 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms