Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sprr1aQ62266 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sprr1aQ62266 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sprr1aQ62266 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sprr1aQ62266 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sprr1aQ62266 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sprr1aQ62266 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sprr1aQ62266 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sprr1aQ62266 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sprr1aQ62266 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms