Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp1Q62209 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sycp1Q62209 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sycp1Q62209 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp1Q62209 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp1Q62209 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp1Q62209 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp1Q62209 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sycp1Q62209 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp1Q62209 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sycp1Q62209 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp1Q62209 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp1Q62209 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp1Q62209 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sycp1Q62209 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp1Q62209 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp1Q62209 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sycp1Q62209 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp1Q62209 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp1Q62209 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp1Q62209 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp1Q62209 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sycp1Q62209 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp1Q62209 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp1Q62209 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sycp1Q62209 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms