Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Pde3bQ61409 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pde3bQ61409 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Pde3bQ61409 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pde3bQ61409 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pde3bQ61409 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pde3bQ61409 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Pde3bQ61409 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Pde3bQ61409 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pde3bQ61409 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Pde3bQ61409 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pde3bQ61409 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pde3bQ61409 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pde3bQ61409 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pde3bQ61409 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pde3bQ61409 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pde3bQ61409 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pde3bQ61409 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pde3bQ61409 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pde3bQ61409 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pde3bQ61409 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pde3bQ61409 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pde3bQ61409 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pde3bQ61409 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Pde3bQ61409 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pde3bQ61409 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pde3bQ61409 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Pde3bQ61409 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pde3bQ61409 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pde3bQ61409 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pde3bQ61409 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms