Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
JrkQ60976 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
JrkQ60976 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
JrkQ60976 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
JrkQ60976 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
JrkQ60976 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
JrkQ60976 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
JrkQ60976 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
JrkQ60976 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
JrkQ60976 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
JrkQ60976 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
JrkQ60976 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
JrkQ60976 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
JrkQ60976 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
JrkQ60976 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
JrkQ60976 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
JrkQ60976 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
JrkQ60976 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JrkQ60976 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JrkQ60976 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JrkQ60976 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrkQ60976 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JrkQ60976 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JrkQ60976 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JrkQ60976 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JrkQ60976 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JrkQ60976 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JrkQ60976 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
JrkQ60976 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
JrkQ60976 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrkQ60976 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JrkQ60976 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JrkQ60976 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
JrkQ60976 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JrkQ60976 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JrkQ60976 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JrkQ60976 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JrkQ60976 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JrkQ60976 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms