Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1h2Q60644 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1h2Q60644 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1h2Q60644 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nr1h2Q60644 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nr1h2Q60644 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nr1h2Q60644 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nr1h2Q60644 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nr1h2Q60644 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nr1h2Q60644 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h2Q60644 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h2Q60644 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nr1h2Q60644 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nr1h2Q60644 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h2Q60644 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h2Q60644 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h2Q60644 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nr1h2Q60644 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms