Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nr1h4Q60641 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nr1h4Q60641 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nr1h4Q60641 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nr1h4Q60641 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nr1h4Q60641 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nr1h4Q60641 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1h4Q60641 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nr1h4Q60641 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr1h4Q60641 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr1h4Q60641 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr1h4Q60641 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr1h4Q60641 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h4Q60641 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nr1h4Q60641 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h4Q60641 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1h4Q60641 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1h4Q60641 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1h4Q60641 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms