Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhfpl4Q5U4E0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhfpl4Q5U4E0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhfpl4Q5U4E0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhfpl4Q5U4E0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhfpl4Q5U4E0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lhfpl4Q5U4E0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhfpl4Q5U4E0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhfpl4Q5U4E0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lhfpl4Q5U4E0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lhfpl4Q5U4E0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhfpl4Q5U4E0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhfpl4Q5U4E0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lhfpl4Q5U4E0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl4Q5U4E0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl4Q5U4E0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lhfpl4Q5U4E0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lhfpl4Q5U4E0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lhfpl4Q5U4E0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms