Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Scaf1Q5U4C3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Scaf1Q5U4C3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Scaf1Q5U4C3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Scaf1Q5U4C3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Scaf1Q5U4C3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Scaf1Q5U4C3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Scaf1Q5U4C3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Scaf1Q5U4C3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Scaf1Q5U4C3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Scaf1Q5U4C3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Scaf1Q5U4C3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Scaf1Q5U4C3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Scaf1Q5U4C3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Scaf1Q5U4C3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Scaf1Q5U4C3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Scaf1Q5U4C3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Scaf1Q5U4C3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Scaf1Q5U4C3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Scaf1Q5U4C3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Scaf1Q5U4C3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Scaf1Q5U4C3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Scaf1Q5U4C3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Scaf1Q5U4C3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Scaf1Q5U4C3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Scaf1Q5U4C3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Scaf1Q5U4C3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Scaf1Q5U4C3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Scaf1Q5U4C3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Scaf1Q5U4C3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Scaf1Q5U4C3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Scaf1Q5U4C3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scaf1Q5U4C3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scaf1Q5U4C3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scaf1Q5U4C3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scaf1Q5U4C3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Scaf1Q5U4C3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Scaf1Q5U4C3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Scaf1Q5U4C3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Scaf1Q5U4C3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scaf1Q5U4C3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scaf1Q5U4C3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scaf1Q5U4C3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scaf1Q5U4C3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms