Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r195Q5SVD6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r195Q5SVD6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r195Q5SVD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r195Q5SVD6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r195Q5SVD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vmn1r195Q5SVD6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vmn1r195Q5SVD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms