Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r196Q5SVD5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r196Q5SVD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r196Q5SVD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn1r196Q5SVD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r196Q5SVD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r196Q5SVD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn1r196Q5SVD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r196Q5SVD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r196Q5SVD5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r196Q5SVD5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r196Q5SVD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r196Q5SVD5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r196Q5SVD5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r196Q5SVD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r196Q5SVD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r196Q5SVD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r196Q5SVD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r196Q5SVD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r196Q5SVD5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r196Q5SVD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r196Q5SVD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms