Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r223Q5SSA0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r223Q5SSA0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r223Q5SSA0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r223Q5SSA0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r223Q5SSA0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r223Q5SSA0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r223Q5SSA0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r223Q5SSA0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r223Q5SSA0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r223Q5SSA0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r223Q5SSA0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r223Q5SSA0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r223Q5SSA0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r223Q5SSA0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r223Q5SSA0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms