Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trdv4Q5R1A3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trdv4Q5R1A3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trdv4Q5R1A3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trdv4Q5R1A3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trdv4Q5R1A3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trdv4Q5R1A3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trdv4Q5R1A3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trdv4Q5R1A3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trdv4Q5R1A3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trdv4Q5R1A3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trdv4Q5R1A3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trdv4Q5R1A3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trdv4Q5R1A3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trdv4Q5R1A3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trdv4Q5R1A3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trdv4Q5R1A3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trdv4Q5R1A3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trdv4Q5R1A3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trdv4Q5R1A3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trdv4Q5R1A3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms