Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3558Q5FWC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3558Q5FWC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm3558Q5FWC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm3558Q5FWC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm3558Q5FWC9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm3558Q5FWC9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm3558Q5FWC9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3558Q5FWC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3558Q5FWC9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3558Q5FWC9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3558Q5FWC9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3558Q5FWC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3558Q5FWC9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3558Q5FWC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3558Q5FWC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm3558Q5FWC9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 321.2 ms