Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc3Q5DU56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc3Q5DU56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc3Q5DU56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc3Q5DU56 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc3Q5DU56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc3Q5DU56 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc3Q5DU56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc3Q5DU56 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc3Q5DU56 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc3Q5DU56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc3Q5DU56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc3Q5DU56 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrc3Q5DU56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc3Q5DU56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrc3Q5DU56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrc3Q5DU56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc3Q5DU56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nlrc3Q5DU56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrc3Q5DU56 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc3Q5DU56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc3Q5DU56 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc3Q5DU56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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