Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sfmbt2Q5DTW2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sfmbt2Q5DTW2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sfmbt2Q5DTW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfmbt2Q5DTW2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sfmbt2Q5DTW2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sfmbt2Q5DTW2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sfmbt2Q5DTW2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfmbt2Q5DTW2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sfmbt2Q5DTW2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sfmbt2Q5DTW2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sfmbt2Q5DTW2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sfmbt2Q5DTW2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sfmbt2Q5DTW2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sfmbt2Q5DTW2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sfmbt2Q5DTW2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sfmbt2Q5DTW2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms