Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp13Q5BKP2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp13Q5BKP2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp13Q5BKP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp13Q5BKP2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp13Q5BKP2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp13Q5BKP2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp13Q5BKP2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp13Q5BKP2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp13Q5BKP2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp13Q5BKP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp13Q5BKP2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp13Q5BKP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp13Q5BKP2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp13Q5BKP2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp13Q5BKP2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp13Q5BKP2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp13Q5BKP2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp13Q5BKP2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp13Q5BKP2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp13Q5BKP2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp13Q5BKP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp13Q5BKP2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp13Q5BKP2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp13Q5BKP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp13Q5BKP2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp13Q5BKP2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp13Q5BKP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Usp13Q5BKP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp13Q5BKP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms