Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmoQ562D6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmoQ562D6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrmoQ562D6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TrmoQ562D6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrmoQ562D6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrmoQ562D6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TrmoQ562D6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TrmoQ562D6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TrmoQ562D6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TrmoQ562D6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TrmoQ562D6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrmoQ562D6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrmoQ562D6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrmoQ562D6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TrmoQ562D6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TrmoQ562D6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrmoQ562D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrmoQ562D6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms