Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ankrd28Q505D1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd28Q505D1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd28Q505D1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ankrd28Q505D1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd28Q505D1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd28Q505D1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ankrd28Q505D1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd28Q505D1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd28Q505D1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd28Q505D1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd28Q505D1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd28Q505D1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd28Q505D1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ankrd28Q505D1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd28Q505D1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd28Q505D1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ankrd28Q505D1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ankrd28Q505D1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd28Q505D1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms