Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Garnl3Q3V0G7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Garnl3Q3V0G7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Garnl3Q3V0G7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Garnl3Q3V0G7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Garnl3Q3V0G7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Garnl3Q3V0G7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Garnl3Q3V0G7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Garnl3Q3V0G7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Garnl3Q3V0G7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Garnl3Q3V0G7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Garnl3Q3V0G7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Garnl3Q3V0G7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Garnl3Q3V0G7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Garnl3Q3V0G7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Garnl3Q3V0G7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Garnl3Q3V0G7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Garnl3Q3V0G7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Garnl3Q3V0G7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Garnl3Q3V0G7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms