Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Zmat1Q3V0C1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zmat1Q3V0C1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zmat1Q3V0C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Zmat1Q3V0C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Zmat1Q3V0C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zmat1Q3V0C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zmat1Q3V0C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zmat1Q3V0C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zmat1Q3V0C1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmat1Q3V0C1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmat1Q3V0C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmat1Q3V0C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmat1Q3V0C1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmat1Q3V0C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmat1Q3V0C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zmat1Q3V0C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zmat1Q3V0C1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zmat1Q3V0C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zmat1Q3V0C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zmat1Q3V0C1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zmat1Q3V0C1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms