Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clpsl2Q3UW21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clpsl2Q3UW21 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clpsl2Q3UW21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clpsl2Q3UW21 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clpsl2Q3UW21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clpsl2Q3UW21 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clpsl2Q3UW21 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Clpsl2Q3UW21 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clpsl2Q3UW21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clpsl2Q3UW21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clpsl2Q3UW21 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clpsl2Q3UW21 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clpsl2Q3UW21 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Clpsl2Q3UW21 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clpsl2Q3UW21 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clpsl2Q3UW21 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clpsl2Q3UW21 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clpsl2Q3UW21 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clpsl2Q3UW21 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clpsl2Q3UW21 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clpsl2Q3UW21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clpsl2Q3UW21 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clpsl2Q3UW21 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clpsl2Q3UW21 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clpsl2Q3UW21 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms