Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE8

Ctxn2, Cortexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn2Q3URE8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctxn2Q3URE8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctxn2Q3URE8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctxn2Q3URE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctxn2Q3URE8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctxn2Q3URE8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctxn2Q3URE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctxn2Q3URE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctxn2Q3URE8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctxn2Q3URE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctxn2Q3URE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctxn2Q3URE8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctxn2Q3URE8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctxn2Q3URE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctxn2Q3URE8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms