Protein–RNA interactions for Protein: Q3U829

Ap5z1, AP-5 complex subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5z1Q3U829 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap5z1Q3U829 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap5z1Q3U829 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ap5z1Q3U829 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ap5z1Q3U829 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ap5z1Q3U829 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap5z1Q3U829 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap5z1Q3U829 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ap5z1Q3U829 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ap5z1Q3U829 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ap5z1Q3U829 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ap5z1Q3U829 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ap5z1Q3U829 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap5z1Q3U829 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap5z1Q3U829 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ap5z1Q3U829 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap5z1Q3U829 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ap5z1Q3U829 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap5z1Q3U829 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap5z1Q3U829 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap5z1Q3U829 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap5z1Q3U829 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap5z1Q3U829 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ap5z1Q3U829 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ap5z1Q3U829 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ap5z1Q3U829 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap5z1Q3U829 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms