Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3U4G0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3U4G0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3U4G0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3U4G0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q3U4G0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3U4G0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3U4G0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3U4G0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3U4G0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3U4G0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3U4G0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q3U4G0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3U4G0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q3U4G0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q3U4G0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q3U4G0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q3U4G0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Q3U4G0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3U4G0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3U4G0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q3U4G0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q3U4G0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3U4G0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3U4G0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3U4G0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3U4G0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3U4G0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q3U4G0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms