Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2I3

Fam160a2, FTS and Hook-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam160a2Q3U2I3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam160a2Q3U2I3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam160a2Q3U2I3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam160a2Q3U2I3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam160a2Q3U2I3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam160a2Q3U2I3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam160a2Q3U2I3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam160a2Q3U2I3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam160a2Q3U2I3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam160a2Q3U2I3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam160a2Q3U2I3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam160a2Q3U2I3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam160a2Q3U2I3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam160a2Q3U2I3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam160a2Q3U2I3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam160a2Q3U2I3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam160a2Q3U2I3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam160a2Q3U2I3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam160a2Q3U2I3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam160a2Q3U2I3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam160a2Q3U2I3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam160a2Q3U2I3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam160a2Q3U2I3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam160a2Q3U2I3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam160a2Q3U2I3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam160a2Q3U2I3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam160a2Q3U2I3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam160a2Q3U2I3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam160a2Q3U2I3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fam160a2Q3U2I3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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