Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde12Q3TIU4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde12Q3TIU4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde12Q3TIU4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde12Q3TIU4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde12Q3TIU4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde12Q3TIU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde12Q3TIU4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde12Q3TIU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde12Q3TIU4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pde12Q3TIU4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pde12Q3TIU4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pde12Q3TIU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pde12Q3TIU4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pde12Q3TIU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pde12Q3TIU4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pde12Q3TIU4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pde12Q3TIU4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde12Q3TIU4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde12Q3TIU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde12Q3TIU4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde12Q3TIU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms