Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V1rd19Q3KNP5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V1rd19Q3KNP5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V1rd19Q3KNP5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V1rd19Q3KNP5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
V1rd19Q3KNP5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
V1rd19Q3KNP5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
V1rd19Q3KNP5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V1rd19Q3KNP5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V1rd19Q3KNP5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V1rd19Q3KNP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
V1rd19Q3KNP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
V1rd19Q3KNP5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
V1rd19Q3KNP5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
V1rd19Q3KNP5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms