Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Treml2Q2LA85 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Treml2Q2LA85 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Treml2Q2LA85 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Treml2Q2LA85 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Treml2Q2LA85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Treml2Q2LA85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Treml2Q2LA85 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Treml2Q2LA85 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Treml2Q2LA85 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml2Q2LA85 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Treml2Q2LA85 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml2Q2LA85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml2Q2LA85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Treml2Q2LA85 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Treml2Q2LA85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Treml2Q2LA85 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Treml2Q2LA85 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml2Q2LA85 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Treml2Q2LA85 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Treml2Q2LA85 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Treml2Q2LA85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms