Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spatc1Q148B6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spatc1Q148B6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spatc1Q148B6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spatc1Q148B6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spatc1Q148B6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spatc1Q148B6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spatc1Q148B6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spatc1Q148B6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spatc1Q148B6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spatc1Q148B6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spatc1Q148B6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spatc1Q148B6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spatc1Q148B6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spatc1Q148B6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spatc1Q148B6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spatc1Q148B6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms