Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ppp4r2Q0VGB7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ppp4r2Q0VGB7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ppp4r2Q0VGB7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ppp4r2Q0VGB7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ppp4r2Q0VGB7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ppp4r2Q0VGB7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ppp4r2Q0VGB7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ppp4r2Q0VGB7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ppp4r2Q0VGB7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ppp4r2Q0VGB7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppp4r2Q0VGB7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ppp4r2Q0VGB7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ppp4r2Q0VGB7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ppp4r2Q0VGB7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ppp4r2Q0VGB7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ppp4r2Q0VGB7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppp4r2Q0VGB7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ppp4r2Q0VGB7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppp4r2Q0VGB7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ppp4r2Q0VGB7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppp4r2Q0VGB7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ppp4r2Q0VGB7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppp4r2Q0VGB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppp4r2Q0VGB7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppp4r2Q0VGB7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ppp4r2Q0VGB7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.8 ms