Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CbfbQ08024 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CbfbQ08024 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CbfbQ08024 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CbfbQ08024 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CbfbQ08024 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CbfbQ08024 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CbfbQ08024 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CbfbQ08024 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CbfbQ08024 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CbfbQ08024 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CbfbQ08024 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CbfbQ08024 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CbfbQ08024 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CbfbQ08024 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CbfbQ08024 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CbfbQ08024 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CbfbQ08024 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CbfbQ08024 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CbfbQ08024 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CbfbQ08024 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CbfbQ08024 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CbfbQ08024 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms