Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SrstQ06666 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrstQ06666 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrstQ06666 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrstQ06666 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrstQ06666 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SrstQ06666 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SrstQ06666 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrstQ06666 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrstQ06666 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrstQ06666 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SrstQ06666 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SrstQ06666 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrstQ06666 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SrstQ06666 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrstQ06666 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms