Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPINDOCQ05AH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPINDOCQ05AH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPINDOCQ05AH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPINDOCQ05AH6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPINDOCQ05AH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPINDOCQ05AH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPINDOCQ05AH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPINDOCQ05AH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPINDOCQ05AH6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPINDOCQ05AH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPINDOCQ05AH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPINDOCQ05AH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPINDOCQ05AH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPINDOCQ05AH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPINDOCQ05AH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SPINDOCQ05AH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPINDOCQ05AH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPINDOCQ05AH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPINDOCQ05AH6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPINDOCQ05AH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPINDOCQ05AH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPINDOCQ05AH6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPINDOCQ05AH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPINDOCQ05AH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPINDOCQ05AH6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPINDOCQ05AH6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPINDOCQ05AH6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPINDOCQ05AH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPINDOCQ05AH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPINDOCQ05AH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms