Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lama4P97927 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lama4P97927 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lama4P97927 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lama4P97927 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lama4P97927 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lama4P97927 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lama4P97927 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lama4P97927 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lama4P97927 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lama4P97927 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lama4P97927 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Lama4P97927 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lama4P97927 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lama4P97927 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lama4P97927 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lama4P97927 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lama4P97927 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lama4P97927 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lama4P97927 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lama4P97927 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lama4P97927 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lama4P97927 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lama4P97927 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Lama4P97927 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Lama4P97927 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lama4P97927 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lama4P97927 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lama4P97927 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Lama4P97927 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lama4P97927 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lama4P97927 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lama4P97927 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lama4P97927 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Lama4P97927 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lama4P97927 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Lama4P97927 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Lama4P97927 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Lama4P97927 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Lama4P97927 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lama4P97927 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lama4P97927 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lama4P97927 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lama4P97927 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lama4P97927 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lama4P97927 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lama4P97927 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lama4P97927 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lama4P97927 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lama4P97927 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lama4P97927 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lama4P97927 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lama4P97927 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lama4P97927 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lama4P97927 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lama4P97927 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lama4P97927 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lama4P97927 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lama4P97927 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lama4P97927 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lama4P97927 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lama4P97927 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lama4P97927 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lama4P97927 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lama4P97927 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lama4P97927 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lama4P97927 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lama4P97927 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Lama4P97927 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lama4P97927 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lama4P97927 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lama4P97927 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lama4P97927 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lama4P97927 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lama4P97927 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms