Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nkx3-2P97503 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nkx3-2P97503 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nkx3-2P97503 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nkx3-2P97503 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nkx3-2P97503 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx3-2P97503 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx3-2P97503 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx3-2P97503 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx3-2P97503 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nkx3-2P97503 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx3-2P97503 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx3-2P97503 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx3-2P97503 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nkx3-2P97503 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nkx3-2P97503 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx3-2P97503 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx3-2P97503 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx3-2P97503 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nkx3-2P97503 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nkx3-2P97503 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms