Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx2P81066 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx2P81066 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx2P81066 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx2P81066 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx2P81066 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Irx2P81066 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx2P81066 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx2P81066 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Irx2P81066 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Irx2P81066 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx2P81066 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Irx2P81066 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx2P81066 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx2P81066 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx2P81066 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx2P81066 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx2P81066 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx2P81066 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx2P81066 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx2P81066 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx2P81066 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Irx2P81066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Irx2P81066 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Irx2P81066 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx2P81066 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx2P81066 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx2P81066 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Irx2P81066 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Irx2P81066 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irx2P81066 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irx2P81066 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx2P81066 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx2P81066 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx2P81066 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Irx2P81066 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Irx2P81066 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx2P81066 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx2P81066 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx2P81066 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx2P81066 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx2P81066 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx2P81066 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx2P81066 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx2P81066 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281 ms