Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Smad1P70340 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Smad1P70340 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smad1P70340 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smad1P70340 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smad1P70340 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smad1P70340 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smad1P70340 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smad1P70340 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smad1P70340 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smad1P70340 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Smad1P70340 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smad1P70340 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smad1P70340 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smad1P70340 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smad1P70340 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smad1P70340 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smad1P70340 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad1P70340 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smad1P70340 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smad1P70340 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smad1P70340 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smad1P70340 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smad1P70340 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smad1P70340 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smad1P70340 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smad1P70340 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smad1P70340 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smad1P70340 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smad1P70340 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smad1P70340 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smad1P70340 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smad1P70340 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smad1P70340 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Smad1P70340 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad1P70340 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smad1P70340 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smad1P70340 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smad1P70340 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms