Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cplx1P63040 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cplx1P63040 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cplx1P63040 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cplx1P63040 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cplx1P63040 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cplx1P63040 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cplx1P63040 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cplx1P63040 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cplx1P63040 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cplx1P63040 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cplx1P63040 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cplx1P63040 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cplx1P63040 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cplx1P63040 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cplx1P63040 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cplx1P63040 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cplx1P63040 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cplx1P63040 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cplx1P63040 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cplx1P63040 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cplx1P63040 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cplx1P63040 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cplx1P63040 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cplx1P63040 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cplx1P63040 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cplx1P63040 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cplx1P63040 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cplx1P63040 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cplx1P63040 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cplx1P63040 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cplx1P63040 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cplx1P63040 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cplx1P63040 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cplx1P63040 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cplx1P63040 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cplx1P63040 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms