Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gnb1P62874 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gnb1P62874 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gnb1P62874 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gnb1P62874 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gnb1P62874 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gnb1P62874 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gnb1P62874 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gnb1P62874 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gnb1P62874 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gnb1P62874 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gnb1P62874 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gnb1P62874 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gnb1P62874 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gnb1P62874 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gnb1P62874 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnb1P62874 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.8 ms