Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpd2P62317 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snrpd2P62317 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrpd2P62317 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrpd2P62317 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrpd2P62317 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpd2P62317 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpd2P62317 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpd2P62317 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpd2P62317 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpd2P62317 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpd2P62317 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrpd2P62317 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrpd2P62317 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrpd2P62317 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snrpd2P62317 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms