Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Smg6P61406 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Smg6P61406 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Smg6P61406 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Smg6P61406 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Smg6P61406 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Smg6P61406 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Smg6P61406 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Smg6P61406 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Smg6P61406 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Smg6P61406 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Smg6P61406 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Smg6P61406 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Smg6P61406 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Smg6P61406 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Smg6P61406 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Smg6P61406 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smg6P61406 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Smg6P61406 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smg6P61406 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smg6P61406 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smg6P61406 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smg6P61406 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smg6P61406 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smg6P61406 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smg6P61406 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smg6P61406 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Smg6P61406 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Smg6P61406 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Smg6P61406 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Smg6P61406 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Smg6P61406 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Smg6P61406 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Smg6P61406 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smg6P61406 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Smg6P61406 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Smg6P61406 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Smg6P61406 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Smg6P61406 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Smg6P61406 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Smg6P61406 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Smg6P61406 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Smg6P61406 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Smg6P61406 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Smg6P61406 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smg6P61406 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Smg6P61406 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smg6P61406 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Smg6P61406 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Smg6P61406 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smg6P61406 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Smg6P61406 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smg6P61406 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smg6P61406 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Smg6P61406 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms