Protein–RNA interactions for Protein: P60122

Ruvbl1, RuvB-like 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ruvbl1P60122 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ruvbl1P60122 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ruvbl1P60122 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ruvbl1P60122 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ruvbl1P60122 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ruvbl1P60122 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ruvbl1P60122 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ruvbl1P60122 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ruvbl1P60122 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ruvbl1P60122 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ruvbl1P60122 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ruvbl1P60122 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ruvbl1P60122 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ruvbl1P60122 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ruvbl1P60122 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ruvbl1P60122 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ruvbl1P60122 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ruvbl1P60122 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ruvbl1P60122 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ruvbl1P60122 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ruvbl1P60122 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ruvbl1P60122 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ruvbl1P60122 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ruvbl1P60122 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ruvbl1P60122 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ruvbl1P60122 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ruvbl1P60122 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms