Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm2aP59997 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm2aP59997 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Kdm2aP59997 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm2aP59997 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm2aP59997 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm2aP59997 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Kdm2aP59997 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm2aP59997 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Kdm2aP59997 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm2aP59997 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm2aP59997 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm2aP59997 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm2aP59997 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm2aP59997 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm2aP59997 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm2aP59997 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm2aP59997 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm2aP59997 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm2aP59997 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm2aP59997 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm2aP59997 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm2aP59997 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm2aP59997 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm2aP59997 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kdm2aP59997 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kdm2aP59997 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm2aP59997 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm2aP59997 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm2aP59997 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm2aP59997 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm2aP59997 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Kdm2aP59997 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Kdm2aP59997 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Kdm2aP59997 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Kdm2aP59997 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Kdm2aP59997 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Kdm2aP59997 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Kdm2aP59997 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Kdm2aP59997 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Kdm2aP59997 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Kdm2aP59997 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Kdm2aP59997 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Kdm2aP59997 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm2aP59997 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Kdm2aP59997 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Kdm2aP59997 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Kdm2aP59997 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Kdm2aP59997 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms