Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm9sf2P58021 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm9sf2P58021 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm9sf2P58021 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm9sf2P58021 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tm9sf2P58021 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm9sf2P58021 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tm9sf2P58021 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tm9sf2P58021 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tm9sf2P58021 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tm9sf2P58021 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tm9sf2P58021 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tm9sf2P58021 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tm9sf2P58021 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tm9sf2P58021 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tm9sf2P58021 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tm9sf2P58021 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm9sf2P58021 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm9sf2P58021 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm9sf2P58021 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm9sf2P58021 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms