Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AgrpP56473 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AgrpP56473 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AgrpP56473 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AgrpP56473 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrpP56473 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrpP56473 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AgrpP56473 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AgrpP56473 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AgrpP56473 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AgrpP56473 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrpP56473 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AgrpP56473 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AgrpP56473 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AgrpP56473 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AgrpP56473 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AgrpP56473 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AgrpP56473 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AgrpP56473 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AgrpP56473 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AgrpP56473 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrpP56473 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AgrpP56473 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AgrpP56473 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrpP56473 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AgrpP56473 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AgrpP56473 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AgrpP56473 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AgrpP56473 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AgrpP56473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrpP56473 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrpP56473 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AgrpP56473 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrpP56473 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AgrpP56473 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AgrpP56473 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AgrpP56473 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AgrpP56473 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AgrpP56473 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AgrpP56473 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AgrpP56473 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms