Protein–RNA interactions for Protein: P56135

Atp5j2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5j2P56135 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp5j2P56135 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp5j2P56135 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp5j2P56135 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp5j2P56135 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp5j2P56135 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp5j2P56135 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp5j2P56135 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp5j2P56135 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp5j2P56135 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp5j2P56135 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp5j2P56135 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp5j2P56135 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp5j2P56135 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp5j2P56135 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp5j2P56135 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp5j2P56135 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp5j2P56135 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp5j2P56135 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp5j2P56135 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp5j2P56135 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp5j2P56135 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp5j2P56135 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp5j2P56135 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms