Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StomP54116 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
StomP54116 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StomP54116 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StomP54116 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StomP54116 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
StomP54116 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
StomP54116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StomP54116 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StomP54116 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StomP54116 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StomP54116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StomP54116 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StomP54116 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StomP54116 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
StomP54116 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StomP54116 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StomP54116 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StomP54116 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StomP54116 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
StomP54116 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StomP54116 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StomP54116 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
StomP54116 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StomP54116 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StomP54116 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
StomP54116 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
StomP54116 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
StomP54116 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
StomP54116 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StomP54116 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
StomP54116 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StomP54116 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StomP54116 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
StomP54116 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
StomP54116 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StomP54116 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StomP54116 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StomP54116 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
StomP54116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
StomP54116 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StomP54116 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StomP54116 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StomP54116 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
StomP54116 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
StomP54116 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
StomP54116 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
StomP54116 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StomP54116 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StomP54116 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StomP54116 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
StomP54116 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StomP54116 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
StomP54116 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
StomP54116 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StomP54116 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StomP54116 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
StomP54116 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StomP54116 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
StomP54116 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StomP54116 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
StomP54116 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
StomP54116 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StomP54116 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StomP54116 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StomP54116 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StomP54116 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StomP54116 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StomP54116 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StomP54116 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StomP54116 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StomP54116 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StomP54116 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
StomP54116 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
StomP54116 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
StomP54116 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
StomP54116 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
StomP54116 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
StomP54116 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
StomP54116 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
StomP54116 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
StomP54116 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
StomP54116 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
StomP54116 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
StomP54116 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StomP54116 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
StomP54116 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StomP54116 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
StomP54116 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StomP54116 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
StomP54116 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StomP54116 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
StomP54116 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
StomP54116 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
StomP54116 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
StomP54116 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
StomP54116 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StomP54116 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
StomP54116 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
StomP54116 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms