Protein–RNA interactions for Protein: P52912

Tia1, Nucleolysin TIA-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tia1P52912 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tia1P52912 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tia1P52912 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tia1P52912 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tia1P52912 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tia1P52912 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tia1P52912 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tia1P52912 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tia1P52912 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tia1P52912 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tia1P52912 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tia1P52912 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tia1P52912 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tia1P52912 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tia1P52912 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tia1P52912 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tia1P52912 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tia1P52912 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tia1P52912 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tia1P52912 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tia1P52912 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tia1P52912 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tia1P52912 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tia1P52912 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tia1P52912 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tia1P52912 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tia1P52912 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tia1P52912 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms