Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Polr1cP52432 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Polr1cP52432 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr1cP52432 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Polr1cP52432 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Polr1cP52432 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Polr1cP52432 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1cP52432 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Polr1cP52432 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Polr1cP52432 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Polr1cP52432 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1cP52432 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1cP52432 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1cP52432 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1cP52432 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Polr1cP52432 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr1cP52432 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1cP52432 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr1cP52432 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr1cP52432 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Polr1cP52432 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Polr1cP52432 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Polr1cP52432 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms